「フローライト」……、それは蛍石と呼称される鉱石（宝石）。
火の中に入れるとホタルのように美しい輝きを放つが、すぐに砕けて散ってしまう儚い石……。
午前の授業が終わり校舎裏で昼休憩していた“宇喜田珪一（主人公）”は、倒れている女生徒を見つけて駆け寄る。
それは幼馴染の“松川ほたる”だった。
慌てて、介抱しようとするが、手助けはいらないとばかりに拒絶する彼女。
しかし、また気を失ってしまう。
彼女を保健室に運び込んで、ふと保健室で利用記入帳を覗いてみると、ほたるがここの常連であることがわかった。
ほたるとは、3年前まで交際していたが、別れてからはほとんど会うことはなかった。
当時は、陸上部のスプリンターとして活躍していたほど快活だった彼女が、こんなにも病弱になってしまっていたとは……。
そして、後日、ほたるが肺癌に侵され、あと数ヶ月の命だということを知った珪一は……。

主人公・相庭晃平（あいばこうへい）は22歳の就職浪人。
優しい管理人・四条英里香（しじょうえりか）の計らいで、晃平は自宅のアパート一階で営まれているアンティークショップ『LA SAISON』（ラ・セゾン）に就職先が見付かるまで臨時店員として雇ってもらうことに。
ある日、晃平がいつものように退屈な店番をしていると、同じアパートの住人・中路瑠理（なかみちるり）が専門学校から戻ってくる。
些細なことから口論となり、晃平は瑠理の機嫌を取るためにガチャポンを買いに行かされる。
苦難の末になんとか持ち帰ったカプセルを瑠理に渡すと、彼女はそれを「アタシの頼んだものじゃない」とあっさり返却。
釈然としない晃平が苛立ち混じりに自室の壁にカプセルを投げ付けると、その中からメイド服の少女・ありすが現れた。