ある春の日、学園に入学した主人公は科学部の勧誘をしていた先輩の女のコに一目惚れする。
そして科学部に行ってみる主人公だが、性悪でマッドサイエンティストな眼鏡ッ娘の科学部部長の策略半強制的に入部させられてしまう。
恰好の部員（モルモット）を手に入れてた桃子は学校の敷地にある祠（ほこら）に眠っていた『秘伝男女交合術』という古文書を元に、いかがわしい実験を試みていた。
しかし、実験はいつも失敗の連続でいつもとんでもない方向に……。
そんな中、科学部の前に頂点とした『図書委員会』が現れ、執拗なまでに古文書を狙い始める……。
怪しげな実験の数々と、図書委員会vs科学部の闘争の去就。
そして、ほのかにちらつく恋の予感を描いた物語です。