季節は夏の足音が聞こえてきたころ。
いつもと変わりない学園生活をおくる主人公・長尾修たち謎部のメンバーの元に「近頃様子が変わってしまった兄のことを調べて欲しい」という依頼が舞い込む。
否応無く事件に巻き込まれていく修たちが出会う怪異の数々。
運命は修に何を求めているのか？ 事件と同時期に現れた謎の転校生に関わりはあるのか？ 空が鮮血に染まるとき、現世に『カクリヨ』が現れる……。