「仮想空間で、逢いましょう……」舞台は今よりもう少し未来。
ＨＭＤ（ヘッドマウントディスプレイ）が一般に普及して、仮想空間を手軽に体験出来る時代です。
『私立南陵学園』では、最先端の仮想空間技術で「ネット授業」を試験的に導入し、その体験学習が話題になりました。
主人公はそこへ通っている、ちょっとさぼり癖があるネットオタク。
幼馴染みの「妹尾夏津奈」はそんな彼の生活を心配しています。
主人公も、そろそろ女の子に興味が出てきたし……っとネット漬けの日々から足を洗おうと考え始めています。
しかし、そんなある日、彼は「ハーレムシミュレーター」という怪しいシミュレーターを発見してしまうのでした。

最先端の仮想空間技術で「ネット授業」を試験的に行う「南陵学園」に通う男子‘秋人（主人公・名前変更可）’は、Webを徘徊し、怪しいデータやプログラムの収拾を趣味とするネットオタク。
しかし、そんな趣味に少々飽きてきた＆女の子にも興味が出てきた年頃の彼は、そんなネット漬けの日々から足を洗おうかと考えていた。
そんなある日、彼は一つのプログラムを見つける。
それは、現実世界の女の子のデータを入力すると、仮想空間で二人っきりの甘い世界を満喫できる「ハーレムシミュレーター」。
早速データを収集し、シミュレーターを起動。
現実世界と比べ、彼女との仲が急速に接近していった。
現実世界へ戻り、学園へと行った主人公は、シミュレーターで仲良くなった女の子との距離が、現実世界でも反映されていることに気が付き……。